公共卫生与生物安全重点实验室设有7个课题组，课题组长与骨干成员如下：
课题组一：传染病与分子病毒学课题组
课题组长：夏雪山
骨干成员：王炳辉、王静林、李静
课题组二：病原生物感染与致病机理课题组
课题组长：庞伟、李盛安
骨干成员：宝福凯、柳爱华、严敏、淳于纬训、李冰雪、孙乐
课题组三：传染性疾病体外诊断技术的开发与应用课题组
课题组长：冯悦
骨干成员：何国忠、张阿梅、刘丽、董书维、缪志江
课题组四：监测防控技术开发运用课题组
课题组长：贾曼红、陈敏
骨干成员：林佶、马艳玲、杨祖顺
课题组五：云南高发及重大疾病人群队列研究课题组
课题组长：蔡乐、游顶云
骨干成员：陈莹、黄源、赵科颖、杨阳
课题组六：环境污染与健康课题组
课题组长：何越峰、文卫华
骨干成员：王立萍、蒋成兰、徐婕、李舒婷
课题组七：营养与食品安全课题组
课题组长：殷建忠
骨干成员：冯月梅、孟琼、汪艳娇、米飞、张俏
