中共昆明医科大学委员会全面深化改革委员会负责学校全面深化改革工作的顶层设计、战略规划、统筹协调、整体推进、督促落实。办公室是学校全面深化改革委员会的常设工作机构，办公室简称学校改革办，负责处理学校全面深化改革委员会的日常事务。主要职责如下：
一、负责组织开展学校发展改革重大问题的咨询和研究。
二、负责统筹协调学校全面深化改革工作，拟订学校发展改革中长期规划、重大政策和重大改革方案。
三、负责筹备学校全面深化改革委员会会议，组织实施学校全面深化改革委员会会议决定的事项。
四、负责协调督促相关单位和部门落实学校全面深化改革委员会的决定事项、工作部署和要求。
五、负责收集有关高等教育发展改革的信息资料，编印《昆明医科大学发展改革参考》，供学校全面深化改革委员会成员和相关单位、部门负责人作为决策参考。
六、负责完成学校党委和全面深化改革委员会交办的其他事项。
