昆明医科大学实验动物中心成立于1999年，前身是昆明医科大学动物供应科，隶属于昆明医科大学科技处。2011年，昆明医科大学实验动物中心更名为昆明医科大学实验动物学部（副处级单位），2019年升为正处级单位。目前，实验动物学部主要职责是为学校教学、科研和人才培养提供合格的实验动物，积极开展动物实验技术服务、实验动物相关知识和机能培训、学术交流等，承接各类动物实验生物医药研究项目，促进技术转化，是集生产、实验、教学、科研、社会服务、管理为一体，多功能并重、综合协同发展的综合性部门。
近年来，实验动物学部融入学校和地方经济发展战略，不断强化科研体系建设，积极推进实验平台建设。在过去实验平台薄弱的基础上，大力推进平台建设，积极申请了云南省高校人类重大疾病动物模型建立及应用工程研究中心，云南省高校脑损伤转化创新团队和转化神经科学平台建设专项，在平台建设方面取得了明显的进步。同时，在学校的大力支持下，现已经建成了近两百平米的细胞培养行为学和免疫组化检测平台，平台全面对外开放，服务全校发展并促进学部自身人才队伍建设。近年来获得了国家“十三五”科技支撑计划子课题1项，云南省干细胞生物医药重大专项1项，国家自然科学基金2项，第八批云南省高校重点实验室1项，云南省基础研究计划重点项目1项、面上项目1项，云南省科技厅 昆明医科大学应用基础研究联合专项重点项目3项、面上项目10项、青年项目2项，省教育厅科学研究基金8项，累计科研经费达到1000多万元，有力的支撑和推动了学部的发展。
在科研成果方面，2015年和2017年分别获得自然科学二等奖和三等奖1项，均排名第一；2018年获得云南省科技进步二等奖1项，排名第二；2019年获得云南省卫生科技三等奖1项，排名第一；1人入选昆明市第五批“中青年学术和技术带头人及后备人选”，1人入选云南省青年拔尖人才计划；1人入选云南省中青年学术和技术带头人后备人才；2人入选昆明医科大学“百名中青年学术和技术骨干”，人才队伍质量有明显的提升。
