实验室将制定《云南省公共卫生与生物安全重点实验室建设与运行管理办法制度汇编》，切实加强实验室的内部管理。实验室的日常管理、条件保障和技术支持工作应始终满足教学、科研工作和开放服务的需求，确保实验室运行有序、环境优良、规范达标。
对在本实验室从事研究工作的师生进行规章制度培训，使用者必须遵守实验室各项规章制度，服从实验室责任人的安排，对涉及的工作或活动负相关责任对实验室贵重、精密仪器实行严格登记制度等一系列安全、有效的措施确保实验室安全，涉及动物饲养、动物实验及细胞培养等，均严格按照条例执行管理职责。
实验人员应当熟知《实验室安全管理制度》，严格遵守各项规定要求；服从实验室责任人的指导、安排；首次进行实验时，应当仔细阅读《实验室安全管理制度》和《实验室突发意外事故应急预案》。
实验室空间、资源应当开放共用、共享，接纳和满足对各实验室的使用需求；使用者必须遵守实验室各项规章制度，服从实验室责任人的安排，对涉及的工作或活动负相关责任；对大型仪器设备的使用，按《实验室仪器设备管理制度》中的有关规定执行。
加强实验室内务管理，不同性质、类别的实验应当进行分区进行并有明显标志；实验室内不得存放生活用品和其他杂物；严格执行实验室卫生规定要求，确保环境清洁、有序、整齐、美观；实验完毕，要将实验场所恢复原状，实验产生的垃圾、废弃物，实验人员应当及时收集、处置，分类存放到指定装置；对危险废弃物，按照有关规定严格执行。实验室用材料、药品、低值品、易耗品、低值耐用品、工具、器皿等物品的管理，按照有关规定执行；
实验室购置的备用物品、药品均须列入《实验室物品、药品、危险品、登记册》建账，并由专人妥善保管；实验用药品、试剂要集中并分类存放；严格物品领用登记手续，定期核对检查，保证帐物相符。
实验室消防器材与设备保持完好、到位，实验室研究生等有关人员已学会使用消防器材，注意检查电源、水源、气源等是否安全可靠，及时排除各种隐患。辐射、剧漆、易燃易爆物品按危险药品管理规定领用，妥善保管。实验室严格遵守学校财务管理制度，加强财务监督和核算。各项经费的开支(使用)按依托单位有关经费的管理规定执行。加强固定资产管理，凡是固定资产均应按照依托单位有关规定办理相应的登记手续，任何人不得私自转让或据为己有。
实验室所有文件、表格、簿册、资料、记录并建立电子数据库，实验室责任人员要及时整理、贴加标识、形成案卷、专门存放，保证整齐有序、便于查阅，避免损坏、丢失；对须归档资料，应按有关要求及时办理归档手续（实验室留存复印件一份备案）；对电子文本、记录应当加强保护和备份，避免数据丢失或改动。
